SYBYL下载安装和入门使用学习记录

文章目录

  • 1.SYBYL下载
    • 1.1下载链接
    • 1.2安装包解压
    • 1.3按流程安装
  • 2.SYBYL快速入门
    • 2.1设置目标路径
    • 2.2小分子图构建
    • 2.3创建表单数据库
    • 2.4利用分子立场优化分子
  • 3.蛋白质准备介绍
    • 3.1导入蛋白
    • 3.2蛋白的处理
  • 4.分子对接

1.SYBYL下载

1.1下载链接

链接:https://pan.baidu.com/s/1dzDUqAN6jKLbwvVG3WAC3A?pwd=h0tv
提取码:h0tv

1.2安装包解压


如上图打开文件夹右击以管理员身份运行下载安装SYBYL

1.3按流程安装

在这里插入图片描述
2. 后边主要是要把这个协议搞下就行,没什么需要特别注意的

2.SYBYL快速入门

2.1设置目标路径

在这里插入图片描述
选择一个自己要保存数据的文件夹如下图
在这里插入图片描述

2.2小分子图构建

在这里插入图片描述
生成分子
在这里插入图片描述

2.3创建表单数据库

在这里插入图片描述
创建完以后更新下open
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
导入刚刚生成的分子进入该数据库
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
打开数据库看下
在这里插入图片描述
导入新分子之前一定要open更新表单数据库

2.4利用分子立场优化分子

在这里插入图片描述
这几个可以按照自己的需求设置
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

3.蛋白质准备介绍

3.1导入蛋白

在这里插入图片描述

3.2蛋白的处理

在这里插入图片描述

4.分子对接

转用Autodock等业界更认可的软件了…


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