基因家族进化分析之HmmerSearch批量处理
Hmmer软件安装
Hmmersearch使用
Ensembl和NCBI基因组下载
samtools安装
sudo apt install samtools
此shell脚本可用hmmsearch批量处理文件
需要更名，如拟南芥pep文件更名为ath.pep。
需要将pep文件和hmm文件放在同一文件夹。
预先安装hmmer和samtools软件。
#!/bin/basha=$(ls *.pep)
hmm=$(ls *.hmm)f本文来自互联网用户投稿，文章观点仅代表作者本人，不代表本站立场，不承担相关法律责任。如若转载，请注明出处。 如若内容造成侵权/违法违规/事实不符，请点击【内容举报】进行投诉反馈！