DNA序列找GC-Ratio最高子序列
一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例(定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。
给定一个很长的DNA序列,以及要求的最小子序列长度,研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。
知识点: 字符串
题目来源: 内部整理
练习阶段: 初级
运行时间限制: 10Sec
内存限制: 128MByte
输入:
输入一个string型基因序列,和int型子串的长度
输出:
找出GC比例最高的字串
样例输入:
AACTGTGCACGACCTGA
5
样例输出:
GCACG
#include
#include
#include char *getSubString(char *str,int n)
{char *result=(char*)malloc(sizeof(char)*(n+1));char *p=str;int i,j,len,cnt,maxCnt;char tempChar;len=strlen(str);if(len
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