【眼底数据集】RETOUCH REFUGE IDRiD
文章目录
- REFUGE: CFP 视杯视盘分割
- RETOUCH: SD-OCT 视网膜液分割
- IDRiD: 糖尿病视网膜病变分割
REFUGE: CFP 视杯视盘分割
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图像数据：
- 图像数量：官方公布的训练、验证、测试集合均为
400张 - 图像大小：height * width = 2056 * 2124
- 分辨率：垂直、水平分辨率 96 dpi
分割类别：
- DISC（视盘）：大圆，上图绿色区域
- CUP（视杯）：小圆，上图黄色区域
REFUGE 相关数据：
- DISC 类 DSC 最高 0.9602，CUP 类 DSC 最高 0.8837
数据前处理：
- 数据划分方式
- 直方图均衡化提高图像对比度
- 检测/定位 OD 位置（某种算法进行检测并crop）
数据后处理：
- 删除面积小于100像素的区域，减少 false positives。
- 删除 CUP 未在 DISC 区域内的预测（保证 CUP 要在 DISC 区域内）。
- 对分割结果轮廓做平滑。
数据描述：
- 相机、分辨率，大小，数量，存储格式
数据描述 图：
- 视盘视杯特征上的差异
- 青光眼和非青光眼数据示例，标示 Optic Disc 和 Optic Cup 区域，Cup-to-Disc Ratio（CDR） 的计算方式，CDR 与青光眼诊断的关系。
- OD 垂直直径与 CDR 的数据分布【来源：OD&OC-DL.pdf】
- 青光眼诊断的ROC曲线（sensitivity ~ 1-spectificity）
RETOUCH: SD-OCT 视网膜液分割
图像数据文件：oct.raw 和 oct.mhd
标签文件：reference.raw 和 reference.mhd
图像大小：（height * width * num * volume），/ 表示有多种尺寸
- 设备 Cirrus：512 * 1024 * 128 * 24
- 设备 Spectralis：512 * 496 * 49 * 24
- 设备 Topcon：512 * 650 / 885 * 128 / 64 * 22
病灶类别：
- 【Intraretinal Fluid】IRF (red)，像素值 = 1，视网膜内液
- 【Subretinal Fluid】SRF (green)，像素值 = 2，视网膜下液
- 【Pigment Epithelial Detachment】PED (blue)，像素值 = 3，色素上皮脱离（严格来说非病灶）
四个类别比例：按像素个数统计
- 设备 Cirrus：
Background:IRF:SRF:PED = 245:1:1:1 - 设备 Spectralis：
Background:IRF:SRF:PED = 305:2:2:1 - 设备 Topcon：
Background:IRF:SRF:PED = 1031:2:1:3
原图与标签Overlap ：
训练数据划分：
- 设备 Cirrus：volume 0 ~ 19 用于训练，共
2560张；20 ~ 23 用于测试，共512张。 - 设备 Spectralis：volume 0 ~ 19 用于训练，共
980张；20 ~ 23 用于测试，共196张。 - 设备 Topcon：volume 0 ~ 18 用于训练，共
2304张；19 ~ 21 用于测试，共384张。*注：volume 7 和 13 分别只有 64 张。
RETOUCH 相关数据：
- 设备 Cirrus：IRF 最高 0.85，SRF 最高 0.72，PED 最高 0.82
- 设备 Spectralis：IRF 最高 0.87，SRF 最高 0.73，PED 最高 0.76
- 设备 Topcon：IRF 最高 0.72，SRF 最高 0.81，PED 最高 0.76
论文统计排行榜数据：
Grand Challenge 网站排行榜：
IDRiD: 糖尿病视网膜病变分割
分割任务：
- 病变分割：与糖尿病视网膜病变相关的分割，包括 Microaneurysms（MA），Hemorrhages（HE），Soft Exudates（SE），Hard Exudates（EX）
- 视盘分割：Optic Disc（OD）分割
图像数据：
- 图像数量：共
516张图片，其中用于分割任务的共81张，其中54张用于训练，27张用于分割 - 图像大小：height * width = 2848 * 4288
- 分辨率：垂直、水平分辨率 300 dpi
病灶类别：
- 【Microaneurysms】MA，小动脉瘤
- 【Hemorrhages】HE，出血
- 【Soft Exudates】SE，软性渗出物
- 【Hard Exudates】EX，硬性渗出物
四类病灶在训练集（Set A）和测试集（Set B）中的图像个数：
图 (b) 到 (f) 分别为病灶 MAs, HEs, SEs, EXs 和 OD 的 ground-truth 示例。
IDRiD 相关数据：
- 视盘分割：最高 0.9826
- 四类病灶分割：MA - 0.5017，HE - 0.6804，SE - 0.6995，EX - 0.885
- JD：Jaccard index
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