NPSE(Nucleotide pair spectrum encoding)
NPSE
NPSE 策略计算窗口内所有可能的 k 间隔核苷酸对的出现次数。
特征表示：
f k N P S E = { { A T } 0 , { A A } 0 , . . . , { A A } k , . . . , { C C } k } f^{NPSE}_k=\{\{AT\}_0,\{AA\}_0,...,\{AA\}_k,...,\{CC\}_k\} fkNPSE={{AT}0,{AA}0,...,{AA}k,...,{CC}k}
变量说明：
k k k：表示窗口大小
{ A A } k \{AA\}_k {AA}k：表示k间隔核苷酸对
特征维度： 16 × ( k + 1 ) 16\times(k+1) 16×(k+1) （表示从无间隔到k间隔拼接）
**k间隔核苷酸对：**在序列“AXXXTXC”中，“AT”是一个三间隔的核苷酸对，“TC”是一个间隔的核苷酸对。
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