计算化学---MS学习笔记（建模）

 1、MS中常见模型及其构建思路

MS中建模的基本原则

代表性——抓住研究对象得关键特点，简化而不失真

可用性——尺寸适中、计算量可接受，算得动

 2、分子模型绘制方法

 有机物1 链状结构

有机物2 含环结构

 苯环Kekule式与共振式互相转换：Build->Bonds-> 

  3、晶体模型的构建

3.1 构建晶体必需信息

1 对称信息：即空间群; 一共有230个空间群；

2 晶格常数：3个晶格长度参数+3个晶格角度参数，共6个；

3 晶胞中原子的种类及其三维坐标

3.2 如何获得这些必须的信息（常用数据库 网站 软件）

 3.3 晶体建模（晶体晶胞）

 1 手动建模

查询相关信息（Findit）： 

建立晶胞： Build->Crystals->Build crystal... 

 加入原子：Build->Add atoms

2 导入cif格式文件（路径不可含有中文字符）有些cif格式导入的模型有误，需要仔细核查。（空间群及晶格常数等信息）

4、 溶液模型的构建

 4.1 晶胞模型的分类

4.2 构建溶液模型的基本步骤

1 画出溶液中各组分的分子、离子模型，并设置号力场和电荷

2 获取溶液的密度、浓度信息，计算出溶液中各组分的摩尔比

3 使用AC模块建模

4.3 实例演示

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